Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CitP49025 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CitP49025 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CitP49025 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CitP49025 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms