Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnni3P48787 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnni3P48787 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms