Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rfx2P48379 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms