Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VdrP48281 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VdrP48281 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VdrP48281 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VdrP48281 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VdrP48281 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VdrP48281 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VdrP48281 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VdrP48281 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VdrP48281 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VdrP48281 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VdrP48281 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VdrP48281 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VdrP48281 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VdrP48281 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VdrP48281 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VdrP48281 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VdrP48281 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VdrP48281 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VdrP48281 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VdrP48281 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VdrP48281 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VdrP48281 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VdrP48281 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VdrP48281 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VdrP48281 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms