Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Epb41P48193 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Epb41P48193 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Epb41P48193 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms