Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbx2P48031 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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