Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TgfaP48030 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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