Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo1bP46735 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo1bP46735 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms