Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3caP42337 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms