Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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