Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TfamP40630 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TfamP40630 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TfamP40630 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TfamP40630 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TfamP40630 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TfamP40630 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TfamP40630 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TfamP40630 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TfamP40630 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TfamP40630 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TfamP40630 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TfamP40630 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TfamP40630 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TfamP40630 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TfamP40630 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TfamP40630 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TfamP40630 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TfamP40630 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TfamP40630 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TfamP40630 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TfamP40630 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TfamP40630 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TfamP40630 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TfamP40630 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TfamP40630 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TfamP40630 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TfamP40630 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TfamP40630 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TfamP40630 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TfamP40630 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms