Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chd1P40201 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chd1P40201 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd1P40201 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd1P40201 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd1P40201 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd1P40201 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chd1P40201 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms