Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf2P39429 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms