Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik2P39087 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms