Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprkP35822 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprkP35822 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprkP35822 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprkP35822 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprkP35822 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
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