Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms