Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfc1P35601 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms