Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifnar1P33896 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms