Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hoxc11P31313 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hoxc11P31313 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Hoxc11P31313 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc11P31313 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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