Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc10P31257 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms