Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprmP28828 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprmP28828 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprmP28828 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprmP28828 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprmP28828 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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