Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif5cP28738 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms