Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms