Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms