Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vav1P27870 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vav1P27870 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms