Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo2P25801 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms