Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms