Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PrkchP23298 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkchP23298 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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