Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif3aP23116 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eif3aP23116 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms