Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RarbP22605 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RarbP22605 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RarbP22605 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RarbP22605 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RarbP22605 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RarbP22605 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RarbP22605 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RarbP22605 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RarbP22605 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RarbP22605 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RarbP22605 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RarbP22605 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms