Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SftpcP21841 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms