Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms