Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F3P20352 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F3P20352 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F3P20352 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F3P20352 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F3P20352 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F3P20352 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F3P20352 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F3P20352 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F3P20352 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F3P20352 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F3P20352 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F3P20352 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F3P20352 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms