Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TP20293 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TP20293 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TP20293 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TP20293 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TP20293 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TP20293 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TP20293 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TP20293 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TP20293 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TP20293 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TP20293 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TP20293 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TP20293 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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