Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou5f1P20263 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms