Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka1P18653 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms