Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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