Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sptan1P16546 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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