Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ass1P16460 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ass1P16460 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ass1P16460 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ass1P16460 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms