Protein–RNA interactions for Protein: P14211

Calr, Calreticulin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalrP14211 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CalrP14211 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CalrP14211 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CalrP14211 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CalrP14211 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CalrP14211 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CalrP14211 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CalrP14211 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms