Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd1P13516 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scd1P13516 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms