Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms