Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr4a1P12813 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nr4a1P12813 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nr4a1P12813 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nr4a1P12813 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nr4a1P12813 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nr4a1P12813 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nr4a1P12813 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nr4a1P12813 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nr4a1P12813 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nr4a1P12813 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nr4a1P12813 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Nr4a1P12813 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nr4a1P12813 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nr4a1P12813 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nr4a1P12813 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nr4a1P12813 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms