Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms