Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcp1P11983 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcp1P11983 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcp1P11983 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcp1P11983 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcp1P11983 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcp1P11983 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcp1P11983 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcp1P11983 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcp1P11983 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcp1P11983 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcp1P11983 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcp1P11983 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms