Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spp1P10923 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spp1P10923 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms