Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms