Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms