Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01878 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01878 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01878 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01878 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
P01878 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01878 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01878 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01878 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms