Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01679 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01679 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01679 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01679 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01679 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01679 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01679 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01679 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01679 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01679 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01679 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01679 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms